MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB4

Total Repeats: 3389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009929	ATT	2	6	32242	32247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340681
502	NC_009929	ATT	2	6	32403	32408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340682
503	NC_009929	CCTAT	2	10	32423	32432	20 %	40 %	0 %	40 %	158340682
504	NC_009929	GAA	2	6	32565	32570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340682
505	NC_009929	AAG	2	6	32578	32583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340682
506	NC_009929	TTC	2	6	32584	32589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340682
507	NC_009929	AAG	2	6	32610	32615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340682
508	NC_009929	CTA	2	6	32693	32698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340682
509	NC_009929	C	6	6	32940	32945	0 %	0 %	0 %	100 %	158340682
510	NC_009929	CAT	2	6	32956	32961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340682
511	NC_009929	GAG	2	6	32973	32978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340682
512	NC_009929	ATC	2	6	33009	33014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340682
513	NC_009929	GAT	2	6	33090	33095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340683
514	NC_009929	GAA	2	6	33114	33119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340683
515	NC_009929	GAC	2	6	33126	33131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340683
516	NC_009929	GTG	2	6	33205	33210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340683
517	NC_009929	TGG	2	6	33217	33222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340683
518	NC_009929	TCT	2	6	33244	33249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340683
519	NC_009929	TGG	2	6	33266	33271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340683
520	NC_009929	TAA	2	6	33281	33286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340683
521	NC_009929	CAACAG	3	18	33288	33305	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	158340683
522	NC_009929	TTG	2	6	33358	33363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340683
523	NC_009929	CAG	2	6	33408	33413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340683
524	NC_009929	AGC	2	6	33430	33435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340683
525	NC_009929	GCCT	2	8	33461	33468	0 %	25 %	25 %	50 %	158340683
526	NC_009929	ACA	2	6	33527	33532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340683
527	NC_009929	CAG	2	6	33552	33557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340683
528	NC_009929	AGC	2	6	33610	33615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340683
529	NC_009929	TGA	2	6	33620	33625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340683
530	NC_009929	GCT	2	6	33657	33662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340683
531	NC_009929	GCAAGC	2	12	33685	33696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340683
532	NC_009929	TGA	2	6	33716	33721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340683
533	NC_009929	CTC	2	6	33757	33762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340683
534	NC_009929	CCCAG	2	10	33796	33805	20 %	0 %	20 %	60 %	158340683
535	NC_009929	AT	3	6	33845	33850	50 %	50 %	0 %	0 %	158340683
536	NC_009929	GAT	2	6	33990	33995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340683
537	NC_009929	TCAG	2	8	34118	34125	25 %	25 %	25 %	25 %	158340683
538	NC_009929	CGA	2	6	34156	34161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340683
539	NC_009929	AGGG	2	8	34183	34190	25 %	0 %	75 %	0 %	158340683
540	NC_009929	ATTGGT	2	12	34221	34232	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	158340683
541	NC_009929	AAT	2	6	34260	34265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340683
542	NC_009929	AAC	3	9	34317	34325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340683
543	NC_009929	CTG	2	6	34339	34344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340683
544	NC_009929	GT	3	6	34423	34428	0 %	50 %	50 %	0 %	158340683
545	NC_009929	A	6	6	34443	34448	100 %	0 %	0 %	0 %	158340683
546	NC_009929	CAGCA	2	10	34536	34545	40 %	0 %	20 %	40 %	158340684
547	NC_009929	GA	3	6	34549	34554	50 %	0 %	50 %	0 %	158340684
548	NC_009929	AAC	2	6	34570	34575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340684
549	NC_009929	ATCC	2	8	34599	34606	25 %	25 %	0 %	50 %	158340684
550	NC_009929	CAA	2	6	34624	34629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340684
551	NC_009929	GCTCT	2	10	34699	34708	0 %	40 %	20 %	40 %	158340684
552	NC_009929	TGC	2	6	34743	34748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340684
553	NC_009929	CTC	2	6	34804	34809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340684
554	NC_009929	GTC	2	6	34886	34891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340684
555	NC_009929	AGA	2	6	35385	35390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340685
556	NC_009929	ATA	2	6	35435	35440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340685
557	NC_009929	AGT	2	6	35505	35510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340685
558	NC_009929	TAT	2	6	35548	35553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340685
559	NC_009929	AAT	2	6	35572	35577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340685
560	NC_009929	TAT	2	6	35631	35636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340685
561	NC_009929	A	7	7	35654	35660	100 %	0 %	0 %	0 %	158340685
562	NC_009929	AATG	2	8	35671	35678	50 %	25 %	25 %	0 %	158340685
563	NC_009929	TGC	2	6	35769	35774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340685
564	NC_009929	CTT	2	6	35811	35816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340685
565	NC_009929	AGT	2	6	36161	36166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340686
566	NC_009929	TTCT	2	8	36176	36183	0 %	75 %	0 %	25 %	158340686
567	NC_009929	AAT	2	6	36208	36213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340686
568	NC_009929	ATT	2	6	36257	36262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340686
569	NC_009929	AGC	2	6	36477	36482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340687
570	NC_009929	CTG	2	6	36494	36499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340687
571	NC_009929	AGA	2	6	36530	36535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340687
572	NC_009929	GCA	2	6	36565	36570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340687
573	NC_009929	G	6	6	36996	37001	0 %	0 %	100 %	0 %	158340688
574	NC_009929	GGA	2	6	37066	37071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340688
575	NC_009929	TTG	2	6	37074	37079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340688
576	NC_009929	ATT	2	6	37184	37189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340688
577	NC_009929	GTT	2	6	37222	37227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340688
578	NC_009929	GAT	2	6	37231	37236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340688
579	NC_009929	CCTC	2	8	37270	37277	0 %	25 %	0 %	75 %	158340688
580	NC_009929	GAA	2	6	37348	37353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340688
581	NC_009929	GAG	2	6	37360	37365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340688
582	NC_009929	GGA	2	6	37422	37427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340688
583	NC_009929	ATTG	2	8	37524	37531	25 %	50 %	25 %	0 %	158340688
584	NC_009929	AGC	2	6	37554	37559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340688
585	NC_009929	GCT	2	6	37609	37614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340688
586	NC_009929	TTA	2	6	37669	37674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340688
587	NC_009929	GAA	2	6	37714	37719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340688
588	NC_009929	GGA	2	6	37749	37754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340688
589	NC_009929	AG	3	6	37803	37808	50 %	0 %	50 %	0 %	158340688
590	NC_009929	TCT	2	6	37864	37869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340688
591	NC_009929	TGG	2	6	37910	37915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340688
592	NC_009929	TGA	3	9	38025	38033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340688
593	NC_009929	A	8	8	38130	38137	100 %	0 %	0 %	0 %	158340688
594	NC_009929	CTA	2	6	38319	38324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340688
595	NC_009929	AAG	2	6	38383	38388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340688
596	NC_009929	GCA	2	6	38437	38442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340688
597	NC_009929	AAG	2	6	38509	38514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340688
598	NC_009929	GCA	2	6	38563	38568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340688
599	NC_009929	GGT	2	6	38585	38590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340688
600	NC_009929	AAG	2	6	38635	38640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340688
601	NC_009929	GCA	2	6	38689	38694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340688
602	NC_009929	AAG	2	6	38761	38766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340688
603	NC_009929	GCA	2	6	38815	38820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340688
604	NC_009929	AAG	2	6	38887	38892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340688
605	NC_009929	GCA	2	6	38941	38946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340688
606	NC_009929	GCC	2	6	39074	39079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340688
607	NC_009929	GAA	2	6	39080	39085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340688
608	NC_009929	TGTAC	2	10	39244	39253	20 %	40 %	20 %	20 %	158340689
609	NC_009929	A	6	6	39655	39660	100 %	0 %	0 %	0 %	158340690
610	NC_009929	CTG	2	6	39666	39671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340690
611	NC_009929	GAGC	2	8	39688	39695	25 %	0 %	50 %	25 %	158340690
612	NC_009929	TGA	2	6	39742	39747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340690
613	NC_009929	TTC	2	6	39775	39780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340690
614	NC_009929	GATG	2	8	39817	39824	25 %	25 %	50 %	0 %	158340690
615	NC_009929	TCA	2	6	39979	39984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340690
616	NC_009929	TAA	2	6	40168	40173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340690
617	NC_009929	TGGGT	2	10	40264	40273	0 %	40 %	60 %	0 %	158340690
618	NC_009929	GAC	2	6	40305	40310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340690
619	NC_009929	AT	3	6	40316	40321	50 %	50 %	0 %	0 %	158340690
620	NC_009929	AT	4	8	40354	40361	50 %	50 %	0 %	0 %	158340690
621	NC_009929	TTC	2	6	40362	40367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340690
622	NC_009929	AGTT	2	8	41118	41125	25 %	50 %	25 %	0 %	158340691
623	NC_009929	AGA	2	6	41408	41413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340692
624	NC_009929	GCT	2	6	41432	41437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340692
625	NC_009929	GCACTG	2	12	41438	41449	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158340692
626	NC_009929	ATC	2	6	41474	41479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340692
627	NC_009929	CAA	2	6	41483	41488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340692
628	NC_009929	AGC	2	6	41497	41502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340692
629	NC_009929	CTA	2	6	41548	41553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340692
630	NC_009929	ATC	2	6	41718	41723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340692
631	NC_009929	CAA	2	6	41823	41828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340692
632	NC_009929	TGC	2	6	41863	41868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340692
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635	NC_009929	TAC	2	6	41918	41923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340692
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640	NC_009929	GATT	2	8	42421	42428	25 %	50 %	25 %	0 %	158340692
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644	NC_009929	GTC	2	6	42594	42599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340692
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661	NC_009929	GCAGG	2	10	43583	43592	20 %	0 %	60 %	20 %	158340692
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748	NC_009929	CCA	2	6	50547	50552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340699
749	NC_009929	ATCA	2	8	50597	50604	50 %	25 %	0 %	25 %	158340699
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751	NC_009929	GCAAG	2	10	50860	50869	40 %	0 %	40 %	20 %	158340699
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753	NC_009929	GCA	2	6	50902	50907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340699
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